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  中新网北京7月12日电 (记者 孙自法)海外著明学术期刊《当然》最新在线发表一篇结构生物学论文称,究诘东谈主员操纵东谈主工智能(AI)时代驱动,研发出一种能缱绻新卵白质的深度学习才略,这个名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)的深度学习才略能生成多样功能性卵白质2024年6868骰宝,包括在自然卵白质中从未见过的拓扑结构。

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  该论文先容,深度学习推进了卵白质结构的瞻望和缱绻,但仍需一个通用框架来克服在卵白质缱绻上碰到的多样挑战。扩散模子是一种生成式模拟才略,已被线路在图像和文本生成中很有效,何况似乎也适用于卵白质缱绻。但是,这类模子当今的奏凯率并不高2024年6868骰宝,产生的序列基本不可折叠成目标结构。

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  论文通信作家、好意思国华盛顿大学David Baker和共事及合营者开展究诘标明,通过细调之前报谈过的RoseTTAFold的结构瞻望集中并将其整合到一个降噪扩散模子中,就能生成具有内容道理的卵白质骨架,而卵白质骨架决定了卵白质的格式和功能。该模子(RFdiffusion)能测试领有不同结构元素的缱绻组合,并重新开动产生卵白质。RFdiffusion能施行不同的任务,缱绻单体(卵白质的基本构成单元)、寡聚体(多亚基聚体)和有休养或工业应用远景的复杂结构,如联贯位点。

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  论文作家对数百个缱绻出的对称聚体、金属联贯卵白和联贯卵白的结构和功能进行了实验表征,线路了该才略的实用性。他们还生成了缱绻的一种联贯卵白与其底物(此处为流感血凝素——在流感病毒名义发现的卵白)的复合物并分析了其结构,发现后果与缱绻的模子险些一模相同,从而线路了该才略的准确性。

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  论文作家挂念以为,RFdiffusion是对当今卵白质缱绻才略的一次轮廓纠正,能产生总长度达600个残基的结构,复杂性和准确度齐比之前更高。后续对该才略的进一步纠正2024年6868骰宝,或能缱绻出复杂进度更高的新卵白。(完)



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